Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms