Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms