Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf3Q9QXK7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms