Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms