Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms