Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms