Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms