Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Necap2Q9D1J1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms