Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Stx17Q9D0I4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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