Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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