Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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