Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms