Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms