Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms