Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim7Q923T7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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