Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE1Q8WV22 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms