Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms