Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitrm1Q8K411 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms