Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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