Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Csnka2ipQ8CH19 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Csnka2ipQ8CH19 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Csnka2ipQ8CH19 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnka2ipQ8CH19 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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