Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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