Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc73Q8CDM4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc73Q8CDM4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms