Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pnma8aQ80VM8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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