Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms