Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms