Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmcc1Q69ZZ6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmcc1Q69ZZ6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmcc1Q69ZZ6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmcc1Q69ZZ6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmcc1Q69ZZ6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms