Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc2Q69ZB8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms