Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms