Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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