Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms