Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprnQ60673 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprnQ60673 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PtprnQ60673 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PtprnQ60673 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PtprnQ60673 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PtprnQ60673 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PtprnQ60673 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PtprnQ60673 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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