Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv4Q5R1A3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms