Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srbd1Q497V5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms