Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms