Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms