Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms