Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cib3Q0P523 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms