Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms