Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme1P97371 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme1P97371 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms