Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1bP97358 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms