Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms