Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdcP23738 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdcP23738 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HdcP23738 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HdcP23738 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms