Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms