Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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PtprqP0C5E4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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PtprqP0C5E4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprqP0C5E4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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