Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtaP09225 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtaP09225 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LtaP09225 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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LtaP09225 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtaP09225 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LtaP09225 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LtaP09225 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LtaP09225 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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