Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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