Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ube3aO08759 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ube3aO08759 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ube3aO08759 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ube3aO08759 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ube3aO08759 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ube3aO08759 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ube3aO08759 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ube3aO08759 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3aO08759 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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