Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms