Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17175E9Q528 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17175E9Q528 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17175E9Q528 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17175E9Q528 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17175E9Q528 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm17175E9Q528 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17175E9Q528 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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