Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms